Die Luftqualität hat sich in den letzten zehn Jahren verbessert, allerdings steigen seit 1993 die Kohlendioxid-Emissionen aufgrund der Belastungen durch den Energie- und den verarbeitenden Sektor. Trotz einer CO2-Abgabe gibt es keine steuerliche Begünstigung abgasarmer Kfz. Die Einführung 1995 von bleifreiem Benzin verringerte die Abgase durch den Straßengüterverkehr. Neue Wasserkraftwerke, eine verstärkte Nutzung erneuerbarer Energien, Verringerung des Treibstoffverbrauchs, der Ausbau eines modernen öffentlichen Verkehrs, Ausbau der Fernwärme und Umstellung auf Erdgas sollen die angestrebten CO2-Reduktionen im Rahmen des Kyoto-Protokolls ermöglichen.

In der Abfallwirtschaft bestehen noch erhebliche Defizite, die in den kommenden Jahren ausgeglichen werden müssen. Das Gefahrenpotential wird in großen Teilen der Bevölkerung und auch der Industrie noch nicht gesehen, so dass z.B. Maßnahmen zur Mülltrennung und die Planung von Verbrennungsanlagen politisch schwer durchzusetzen sind. Bei weiterhin steigenden Müllbergen sind häufig nicht sichere Deponien noch immer die einzige Möglichkeit der Entsorgung. Mitte 2003 wurde im Stadtgebiet Ljubljana mit der Mülltrennung und -sortierung begonnen. Die Regierung setzt jetzt auf den Bau überregionaler Abfallzentren.

Wasser ist - mit Ausnahme der Küstenregion - ausreichend vorhanden, in seiner Qualität aber beim Oberflächenwasser belastet, während beim Grundwasser die Kontaminierung zurückgeführt werden konnte und heute auf dem Niveau von Österreich liegt. Die veralteten Trinkwasserleitungen (40% Wasserverlust) bestehen in weiten Teilen aus PVC und sind z.T. asbestbelastet.

Das Abwassersystem und die Abwasserbehandlung sind unzureichend; nur 53% der Haushalte haben Kanalanschluss.